Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm17728E9Q5K2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17728E9Q5K2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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