Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms