Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nolc1E9Q5C9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nolc1E9Q5C9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms