Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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