Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
5430401F13RikE9Q328 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms