Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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