Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms