Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms