Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd1E9PZ26 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brd1E9PZ26 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms