Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5415E9PXF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms