Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms