Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms