Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms