Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3543D3Z235 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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