Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc8D3YZV8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms