Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5475D3YV11 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms