Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms