Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptprz1B9EKR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptprz1B9EKR1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ptprz1B9EKR1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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