Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnldc1B2RXZ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms