Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrr3B2RXA8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms