Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp26c1B2RXA7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms