Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cped1B2RX70 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms