Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clrn2B2RVW2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clrn2B2RVW2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms