Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms