Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rrn3B2RS91 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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