Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JrklB2RRL2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrklB2RRL2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms