Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud4B2RRE7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms