Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf518bB2RRE4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms