Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf1B2RRD7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms