Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zbed5B2RPU8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms