Protein–RNA interactions for Protein: B2KFW1

Zscan20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan20B2KFW1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zscan20B2KFW1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms