Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU022751B1B0V2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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AU022751B1B0V2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU022751B1B0V2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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AU022751B1B0V2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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AU022751B1B0V2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms