Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CK137956B1AYM9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms