Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pramef20B1ARV6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef20B1ARV6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms