Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms