Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lcn6A2AJB9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms