Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8nlA2ABX0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms