Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm16A2A935 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms