Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm2A2A7B5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms