Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l1A2A259 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms