Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0U1RNP2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms