Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms