Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv31A0A075B5J5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trbv31A0A075B5J5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trbv31A0A075B5J5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trbv31A0A075B5J5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Trbv31A0A075B5J5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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