Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB20Q9NX57 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAB20Q9NX57 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms