Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC90BQ9GZT6 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms