Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZBED3Q96IU2 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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