Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB3CQ96E17 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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