Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ANKRD39Q53RE8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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