Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZFHX3Q15911 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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