Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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VAMP3Q15836 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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VAMP3Q15836 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAMP3Q15836 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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